ד"ר יהונתן פרנקו הוא משתלם בתר-דוקטורט במרכז משה דיין. עבודת הדוקטורט שלו עסקה במעורבות האו"ם בסכסוך הערבי-ישראלי בהיבטי השכנת ושמירת שלום בשנים 1947 – 1982 (ממלחמת העצמאות ועד מלחמת לבנון הראשונה). מחקריו הנוכחיים מתמקדים בדיפלומטיה האזורית, הבינלאומית והאו"מית של הסכסוך הערבי-ישראלי.